Mivel Ferenc József túlélte fiát és nejét a Habsburg trón várományosa unokaöccse, a kevéssé kedvelt, kifejezetten magyarellenes és imperialista Ferenc Ferdinánd lett. Miután a monarchia 1908-ban bekebelezte Bosznia-Hercegovinát, a szerb fanatikusok gyűlöletének elsődleges céltáblája lett, hiszen Boszniát a szerbek saját államukon belül akarták mihamarabb tudni. Éppen ezért roppant veszélyes volt a trónörökös házaspár boszniai látogatása, bár a tömeg, amelynek zöme nem szerb volt, kifejezetten örült nekik, hiszen az osztrák uralom sokkal jobb volt, mint a török.
Már a trónörököspár megérkezésekor bomba robbant a szarajevói pályaudvar közelében. A főhercegnek nem esett baja, mert véletlen éppen elhagyta a helyet, 11-n azonban megsérültek a merényletnél. A városi tanácsházán tartott fogadás után a trónörököspár a kórházba indult, hogy meglátogassa a sérülteket, a szerencse azonban ekkor már elpártolt tőlük. Az utat rendőri sorfal biztosította, ám a sofőr véletlenül nem a megfelelő saroknál fordult be. Emiatt Gavrilo Princip, akit a rendőrök látványa kissé távol tartott az eseménytől, egyenesen a kocsihoz szaladt és közvetlen közelből két lövést adott le. Az egyik lövés a főherceget érte a halántékán, a másik Sophie Chotek főhercegnőt az altestén. Ferenc Ferdinánd azonnal meghalt, felesége pedig a közeli kórházba vezető úton. Természetesen a 19 éves merénylőt azonnal letartóztatták, és börtönbüntetésre ítélték, ahol meghalt.